武汉大学医院由医院本部和一个社区卫生服务中心、二个门诊部共计四个机构组成。医院拥有一支思想和业务素质较强的卫生技术队伍，设有门诊和住院部，有内科、外科、妇科、眼科、五官科、口腔科、皮肤科、中医康复科、急诊科、保健科、公共卫生科等十余个临床业务科室；设有放射科、物理诊断科（心电图室和B超室）和检验科等医技科室；设有中、西药房和其它多功能科室。